WWF Verdensnaturfonden ledes af en bestyrelse på op til ni medlemmer. Bestyrelsen består et miks af forretningsfolk og forskere. Alle medlemmer af bestyrelsen er ulønnet.
Bestyrelsesformand Nils Smedegaard Andersen
Professor Carsten Rahbek (næstforperson)
Advokat Johan Løje
Partner Lars Raunholt Eismark
Tidl. direktør Peter Bonne Eriksen
Professor Signe Normand
Lektor Eline Lorenzen
Vice President Louise Münter
CEO Mads Kann Rasmussen